Правовая форма организации характеризует прежде всего специфику имущественных отношений между организацией и ее учредителями, но во внимание принимаются и другие обстоятельства, а именно: конкретные цели и содержание деятельности. Существует перечень важнейших форм некоммерческих организаций, предусмотренных ГК РФ и Законом «О некоммерческих организациях», и ключевые особенности каждой из форм.

Перечень включает: 1) потребительские кооперативы; 2) общественные; 3) религиозные организации (объединения); 4) некоммерческие партнерства; 5) учреждения; 6) автономные некоммерческие организации; 7) объединения юридических лиц (ассоциации и союзы). Высшими органами управления некоммерческих организаций в соответствии с их учредительными документами являются: коллегиальный высший орган управления для автономной некоммерческой организации; общее собрание членов для некоммерческого партнерства, ассоциации (союза). Порядок управления фондом определяется его уставом.

Основные функции высшего органа управления некоммерческой организации: 1) обеспечение соблюдения ею целей, в интересах которых она создана; 2) определение приоритетных направлений деятельности организации, принципов формирования и использования ее имущества; 3) образование исполнительных органов организации и досрочное прекращение их полномочий; 4) утверждение финансового плана, годового отчета и годового бухгалтерского баланса; 5) создание филиалов и открытие представительств некоммерческой организации; 6) участие в других организациях; 7) реорганизация и ликвидация некоммерческой организации (за исключением ликвидации фонда). Общее собрание членов некоммерческой организации или заседание коллегиального органа ее управления правомочно, если на указанном собрании или заседании присутствует более половины членов.

Члены высшего органа управления некоммерческой организации не вправе получать от организации вознаграждение за выполнение своих функций, за исключением компенсации расходов, непосредственно связанных с участием в работе этого органа. Для фондов обязательным является создание попечительского совета. Некоммерческие организации ведут бухгалтерский учет и статистический учет, предоставляют необходимую информацию налоговым органам, собственным учредителям и иным лицам. Размеры и структура доходов и имущества некоммерческой организации, а также сведения о ее расходах, численности работников и волонтеров, оплате труда не могут быть предметом коммерческой тайны. Российское законодательство возлагает на государство ответственность и наделяет его полномочиями контролировать деятельность некоммерческих организаций. Если организация совершает действия, не согласующиеся с ее некоммерческим статусом, ей может быть вынесено письменное предупреждение органом, который ее зарегистрировал, либо прокурор может внести представление об устранении нарушений. Если таких предупреждений или представлений было более двух, возможно возбуждение судебного дела о ликвидации некоммерческой организации.